Сервер / сайты очень медленно загружаются

У меня есть сервер в течение 5 месяцев с установленным Debian 7 Wheezy и cpanel virtual / webmin. Никогда не было никаких проблем, кроме недели назад.

Я не делал никаких изменений на сервере. Проблема заключается в следующем:
Первый раз, когда я проверял веб-сайты неделю назад, я получал соединение DAtabase error 500 на каждом веб-сайте, который посещал на сервере.

Затем я проверил состояние сервера и MySQL не работал. Поэтому я установил это и установил все обновления в virtualmin, а затем перезапустил. Все работало нормально, до 10 минут спустя. Сайт стал очень медленным.
Когда я проверил журнал ошибок, я получил следующее:

[warn] [client ] mod_fcgid: read data timeout in 40 seconds []
[error] [client ] Premature end of script headers: xmlrpc.php

Затем я изменил FcgidConnectTimeout = 600 на 9999 для /etc/apache2/mods-enabled/cfgid.conf. Я снова сделал перезагрузку, и все снова работало быстро. десять минут спустя тот же вопрос. Сайты загружаются очень-очень медленно. Иногда больше пары минут.

Я снова проверил журнал ошибок и обнаружил следующую ошибку:

[warn] [client ] mod_fcgid: can't apply process slot for /home/fcgi-bin/