PhpStorm — новые строки (перевод строки) удаляются при сохранении на удаленный сервер

Использование PhpStorm 2017.1.4

У меня есть строка запроса MySQL в PHP:

<php

$MySQL_Query_String = "SELECT *
FROM  `VISITOR`
WHERE  `ID` =3

-- eventually add the date order here as well
ORDER BY `VISITOR`.`INACTIVE` ASC, `VISITOR`.`NAME` ASC";

?>

Я оставил комментарий, чтобы напомнить себе о чем-то с -- игнорировать этот комментарий.

Когда я запускаю этот код в браузере — тогда эта часть не запускается MySQL:

ORDER BY `VISITOR`.`INACTIVE` ASC, `VISITOR`.`NAME` ASC

Когда я отлаживаю — я вижу, что строка объединяется и отправляется следующим образом:

MySQL_Query_String = "SELECT * FROM  `VISITOR` WHERE  `ID` =3 -- eventually add the date order here as well ORDER BY `VISITOR`.`INACTIVE` ASC, `VISITOR`.`NAME` ASC";

Каналы возврата строки отсутствуют.
Последняя строка теперь игнорируется MySQL.

Самое смешное, что у меня точно такой же код в другом приложении, использующем ту же версию PhpStorm, и он НЕ удаляет переводы строк, подобные упомянутой здесь.

Насколько я могу судить — и я скопировал туда и обратно из каждого приложения — нет никакой разницы.

Я потерял несколько часов, отлаживая это.
Я не сразу увидел, что возврат строк игнорировался.

Почему PhpStorm удаляет перевод строки здесь?