Как создать новый файл в браузере удаленного хоста на phpstorm

Тебе этого не сделать: PhpStorm не поддерживает тип редактирования файлов «только для удаленного редактирования» — вы должны создавать и редактировать файл локально, а затем загружать его на удаленный.

Подумайте об этом: если вы сможете создать файл непосредственно на удаленном сервере … но не сможете отредактировать его, потому что IDE может работать (редактировать) только с локальными файлами … тогда какой смысл в таком пустом удаленном файле?

Относительно папок: ну … это просто папки (у них нет содержимого (в смысле файлового содержимого)) — вы можете свободно перемещать файлы между папками.

ОБНОВЛЕНИЕ (2017/01/16):
Начиная с PhpStorm v9 теперь возможно удаленное редактирование (файл будет загружен во временную папку и не будет сохранен в реальном локальном проекте).

Читайте больше в официальном сообщении в блоге: https://blog.jetbrains.com/phpstorm/2015/04/remote-edit-in-phpstorm-9-eap/

Некоторые возможные недостатки такого редактирования: https://stackoverflow.com/a/36850634/783119