Я получил эту ссылку https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7128?report=xml&Формат = текст. Я пытаюсь написать код, который получает взаимодействия и GeneOntology в Gene-commentary_heading по ссылке. Я успешно использую этот код только тогда, когда есть 2 или 3 узла, но в этом случае есть по крайней мере 6 узлов или больше. Может ли кто-нибудь помочь мне?
Ниже приведен пример информации, которую я ищу (это много для визуализации, поэтому я только что показал часть)
<Gene-commentary_heading>GeneOntology</Gene-commentary_heading>
<Gene-commentary_source>
<Other-source>
<Other-source_pre-text>Provided by</Other-source_pre-text>
<Other-source_anchor>GOA</Other-source_anchor>
<Other-source_url>http://www.ebi.ac.uk/GOA/</Other-source_url>
</Other-source>
</Gene-commentary_source>
<Gene-commentary_comment>
<Gene-commentary>
<Gene-commentary_type value="comment">254</Gene-commentary_type>
<Gene-commentary_label>Function</Gene-commentary_label>
<Gene-commentary_comment>
<Gene-commentary>
<Gene-commentary_type value="comment">254</Gene-commentary_type>
<Gene-commentary_source>
<Other-source>
<Other-source_src>
<Dbtag>
<Dbtag_db>GO</Dbtag_db>
<Dbtag_tag>
<Object-id>
<Object-id_id>3677</Object-id_id>
</Object-id>
</Dbtag_tag>
...
`$url = "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7128?report=xml&format=text";
$document_xml = new DOMDocument();
$document_xml->loadXML($url);
$elements = $url->getElementsByTagName('Gene-commentary_heading');
echo $elements;
foreach($element as $node) {
$GO = $node -> getElementsByTagName('GeneOntology');
$Int = $node->getElementsByTagName('Interactions');
}
Мой ответ
$esearch_test = "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/7128?report=xml&format=text";
$result = file_get_contents($esearch_test);
$xml = simplexml_load_string($result);
$doc = new DOMDocument();
$doc = DOMDocument::loadXML($xml);
$c = 1;
foreach($doc->getElementsByTagName('Gene-commentary_heading') as $node) {
echo "$c: ".$node->textContent."\n";
$c++;
}
Других решений пока нет …