Как обновить программное обеспечение до последней версии, когда мы изменили файлы ядра через Git?

У меня Git (с Sourcetree и Bitbucket) работает на моем локальном хосте. Я изменил некоторые основные файлы для темы, которую я купил (CSS, PNG изображения, PHP). Но теперь кодировщик темы обновил весь исходный код и попросил меня заменить всю тему новой версией.

Итак, как мне перейти на новую версию темы и при этом сохранить изменения, внесенные в некоторые файлы?

Я пытался с тестовым репозиторием на Git, и кажется, что некоторые файлы, как сообщается, были изменены, но изменений, похоже, нет.

Вот скриншот моего дерева источников.