Как лучше всего добавить ряд в конец таблицы на jQuery?

Метод, который Вы сами предложили, скорее всего, не сработает. Потому что в дереве DOM внутри тега TABLE обычно идёт тег TBODY. В результате, получиться нечто такое:

<table id="myTable">
<tbody>
<tr>...</tr>
<tr>...</tr>
</tbody>
<tr>...</tr>
</table>

Поэтому, можно использовать вот-такое решение:

$(''#myTable tr:last'').after(''<tr>...</tr><tr>...</tr>'');

Однако, и оно не сработает, если в таблице нет ни единой строчки :)
А вот-так должно сработать:

$(''#myTable > tbody:last'').append(''<tr>...</tr><tr>...</tr>'');