Добавить класс:
document.getElementById("MyElement").className += " my-class";
Удалить класс:
document.getElementById("MyElement").className = document.getElementById("MyElement").className.replace( /(?:^|\s)MyClass(?!\S)/ , '''' );
В новых браузерах работает такой подход:
document.getElementById(''id'').classList.add(''class''); document.getElementById(''id'').classList.remove(''class'');