python — рассчитать распределение частиц по размерам по измерениям AFM
Я пытаюсь получить распределение радиуса и диаметра из некоторых измерений АСМ (атомно-силовой микроскопии). До сих пор я опробовал Gwyddion, ImageJ и различные рабочие процессы в Matlab.
На данный момент наилучшие результаты, которые я обнаружил, — это использовать Gwyddion и получить фазовое изображение, отфильтровать его верхними частотами, а затем попробовать обнаружение края с помощью «Laplacian of Gaussian». Результат показан на рисунке 3. Однако это изображение все еще слишком шумное и на самом деле не охватывает края всех частиц. (некоторые объединены, другие не имеют четкого периметра).
В конце мне нужно изображение, которое сегментирует каждую из сферических частиц, которые я могу использовать для обнаружения / анализа капель, чтобы получить информацию о размере / радиусе.
Кто-нибудь может порекомендовать другой метод?
[
Решение
Я бы определенно попробовал гранулометрия, это было разработано для чего-то действительно подобного. Есть хорошее объяснение гранулометрии здесь, стартовая страница 158.
Гранулометрия будет выполнять последовательные / увеличивающиеся отверстия, которые будут стирать различные шаблоны в соответствии с их размерами. Чем больше шаблон, тем он будет стерт. Это даст вам кривую, которая представляет распределение размеров шаблона в вашем изображении, именно то, что вы хотите.
Тем не менее, он не даст вам никакой информации о положении внутри изображения. Если вы хотите получить грубое моделирование пятен, присутствующих на вашем изображении, вы можете взглянуть на Окончательное открытие.
Другие решения
Других решений пока нет …