Параллельное сохранение порядка из массива с использованием tbb

у меня есть Диапазон-изображения и хочу превратить его в облако точек libpointmatcher. Облако является Eigen::Matrix с 4 рядами (x, y, z, 1) и несколькими столбцами для каждой точки.
Range-изображение является unsigned short*массив, включающий значения диапазона (z) и unsigned char*массив, включающий информацию о видимости пикселей.

В сериале мой код выглядит так:

//container to hold the data
std::vector<Eigen::Vector4d> vec;
vec.reserve(this->Height*this->Width);

//contains information about pixel visibility
unsigned char* mask_data = (unsigned char*)range_image.mask.ToPointer();
//contains the actual pixel data
unsigned short* pixel_data = (unsigned short*)range_image.pixel.ToPointer();

for (int y =0;y < range_image.Height; y++)
{
for (int x = 0; x < range_image.Width; x++)
{
int index  =x+y*range_image.Width;
if(*(mask_data+index) != 0)
{
vec.push_back(Eigen::Vector4d(x,y,(double)*(data+index),1));
}
}
}
// libpointmatcher point cloud with size of visible pixel
PM::Matrix features(4,vec.size());
PM::DataPoints::Labels featureLabels;
featureLabels.resize(4);
featureLabels[0] =  PM::DataPoints::Label::Label("x");
featureLabels[1] =  PM::DataPoints::Label::Label("y");
featureLabels[2] =  PM::DataPoints::Label::Label("z");
featureLabels[3] =  PM::DataPoints::Label::Label("pad");

//fill with data
for(int i = 0; i<vec.size(); i++)
{
features.col(i) = vec[i];
}

Из-за больших изображений этот цикл занимает 500 мс для 840000 точек, и это слишком медленно. Теперь моя идея заключалась в том, чтобы объединить приведенный выше код в одну парализованную функцию. Проблема в том, что Eigen::Matrix не обеспечивает push_back функциональность, я не знаю заранее количество видимых точек, и мне нужны точки в правильном порядке для обработки облака точек.

Поэтому мне нужен параллельный алгоритм для извлечения видимых 3D-точек из моего Range-изображения и вставки их в Eigen :: Matrix в правильном порядке. Я работаю с Microsoft Visual Studio 2012 и я могу использовать либо OpenMP 2.0 или же TBB. Я ценю любую помощь 🙂

ОБНОВИТЬ

Когда Арк Д. Робисон предложил, я попробовал tbb::parallel_scan, Я передал массив масок и двойной массив для хранения 3D-coodinates. Выходной массив имеет четырехкратный размер входного массива для хранения однородных трехмерных данных (x, y, z, 1). Затем я отображаю массив otput в Eigen :: Matrix. Количество строк фиксировано, а столбцы — в результате параллельного сканирования.

size_t vec_size = width*height;
double* out = new double[vec_size * 4];
size_t m1 = Compress(mask, pixel, out, height, width,
[](unsigned char x)  {return x != 0; });
Map<MatrixXd> features(out, 4, m1);

. Вот код из operator():

void operator()(const tbb::blocked_range2d<size_t, size_t>& r, Tag) {
// Use local variables instead of member fields inside the loop,
// to improve odds that values will be kept in registers.
size_t j = sum;
const unsigned char* m = in;
const unsigned short* p = in2;
T* values = out;
size_t yend = r.rows().end();
for (size_t y = r.rows().begin(); y != yend; ++y)
{
size_t xend = r.cols().end();
for (size_t x = r.cols().begin(); x != xend; ++x)
{
size_t index = x + y*width;
if (pred(m[index]))
{
if (Tag::is_final_scan())
{
size_t idx = j*4;
values[idx] = (double)x;
values[idx + 1] = (double)y;
values[idx + 2] = p[index];
values[idx + 3] = 1.0;
}
++j;
}
}
}
sum = j;
}

Сейчас я в 4 раза быстрее серийной версии. Что вы думаете об этом подходе? Я что-то пропустил и есть улучшения? Спасибо

0

Решение

Вот пример того, как сделать что-то вроде std::copy_if using tbb::parallel_scan, Ключевой метод operator(), который обычно вызывается дважды на поддиапазон, один раз для предварительного сканирования и один раз для окончательного сканирования. (Но имейте в виду, что TBB пропускает предварительное сканирование, когда в этом нет необходимости.) Здесь предварительное сканирование просто выполняет подсчет, а окончательное сканирование выполняет окончательную работу (которая включает в себя воспроизведение подсчета). Увидеть https://software.intel.com/sites/default/files/bc/2b/parallel_scan.pdf для более подробной информации о методах. Еще одна хорошая ссылка https://www.cs.cmu.edu/~guyb/papers/Ble93.pdf , который показывает много вещей, которые вы можете сделать с параллельным сканированием (a.k.a. prefix-sum).

« `

#include "tbb/parallel_scan.h"#include "tbb/blocked_range.h"#include <cstddef>

template<typename T, typename Pred>
class Body {
const T* const in;
T* const out;
Pred pred;
size_t sum;
public:
Body( T* in_, T* out_, Pred pred_) :
in(in_), out(out_), pred(pred_), sum(0)
{}
size_t getSum() const {return sum;}
template<typename Tag>
void operator()( const tbb::blocked_range<size_t>& r, Tag ) {
// Use local variables instead of member fields inside the loop,
// to improve odds that values will be kept in registers.
size_t j = sum;
const T* x = in;
T* y = out;
for( size_t i=r.begin(); i<r.end(); ++i ) {
if( pred(x[i]) ) {
if( Tag::is_final_scan() )
y[j] = x[i];
++j;
}
}
sum = j;
}
// Splitting constructor used for parallel fork.
// Note that it's sum(0), not sum(b.sum), because this
// constructor will be used to compute a partial sum.
// Method reverse_join will put together the two sub-sums.
Body( Body& b, tbb::split ) :
in(b.in), out(b.out), pred(b.pred), sum(0)
{}
// Join partial solutions computed by two Body objects.
// Arguments "this" and "a" correspond to the splitting
// constructor arguments "b" and "this".  That's why
// it's called a reverse join.
void reverse_join( Body& a ) {
sum += a.sum;
}
void assign( Body& b ) {sum=b.sum;}
};

// Copy to out each element of in that satisfies pred.
// Return number of elements copied.
template<typename T, typename Pred>
size_t Compress( T* in, T* out, size_t n, Pred pred ) {
Body<T,Pred> b(in,out,pred);
tbb::parallel_scan(tbb::blocked_range<size_t>(0,n), b);
return b.getSum();
}

#include <cmath>
#include <algorithm>
#include <cassert>

int main() {
const size_t n = 10000000;
float* a = new float[n];
float* b = new float[n];
float* c = new float[n];
for( size_t i=0; i<n; ++i )
a[i] = std::cos(float(i));
size_t m1 = Compress(a, b, n, [](float x) {return x<0;});
size_t m2 = std::copy_if(a, a+n, c, [](float x) {return x<0;})-c;
assert(m1==m2);
for( size_t i=0; i<n; ++i )
assert(b[i]==c[i]);
}

« `

1

Другие решения

Почему бы вам не проверить состояние *(m_maskData+index)==0 до m_features(0,index) = x;?

0

По вопросам рекламы ammmcru@yandex.ru
Adblock
detector