Рассмотрим следующую простую программу:
#include <mpi.h>
#include <iostream>
#include <stdlib.h>
#include <stdio.h>
#include <string>
#include <vector>
using std::cout;
using std::string;
using std::vector;
vector<float> test;
#ifdef GLOBAL
string hostname;
#endif
int main(int argc, char** argv) {
int rank; // The node id of this processor.
int size; // The total number of nodes.
#ifndef GLOBAL
string hostname;
#endif
MPI_Init(&argc, &argv);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
cout << "Joining the job as processor: " << rank << std::endl;
{
char buf[2048] = "HELLO";
hostname.assign(buf, 2048);
}
test.push_back(1.0f);
cout << "Hostname: " << hostname << "::" << test[0] << std::endl;
MPI_Finalize();
return 0;
}
Если я компилирую / запускаю это с:
mpicxx -c test.cc && mpicxx -lstdc++ test.o -o test && ./test
нет ошибки сегментации, но если я запускаю ее с:
mpicxx -DGLOBAL -c test.cc && mpicxx -lstdc++ test.o -o test && ./test
затем возникает ошибка сегментации в строке hostname.assign (). Кроме того, если я удаляю это присваивание, в деструкторе строки возникает ошибка сегментации, когда основной метод возвращается, поэтому метод присвоения не является фактическим виновником.
Обратите внимание, что единственная разница заключается в том, где объявлена «глобальная» переменная hostname.
Я компилирую с MPICH2 версии 1.6, и у меня нет возможности изменить это, так как я запускаю это на суперкомпьютере.
Если я удалю MPI_Init и т. Д., Ошибка исчезнет, и я пойму, что с MPI и этой глобальной переменной происходит нечто неожиданное.
Я нашел несколько других примеров того, как это происходит с людьми в сети, но все они решили свои проблемы, установив новую версию MPICH, что опять-таки не представляется возможным.
Более того, я хочу знать, ПОЧЕМУ это происходит больше, чем просто обойти это.
Спасибо за ваше время.
Хорошо, после небольшой отладки я обнаружил, что библиотека MVAPICH2-1.6 определяет переменную с именем hostname в:
mpid/ch3/channels/mrail/src/rdma/ch3_shmem_coll.c
Вот строка (55 в этой версии файла):
char hostname[SHMEM_COLL_HOSTNAME_LEN];
Компилятор не жаловался на конфликт имен здесь, но это почти наверняка виновник, так как изменение имени переменной в моей программе устранило ошибку. Я предполагаю, что это изменилось в более поздних версиях MVAPICH2, но я сообщу об ошибке, если нет.
Других решений пока нет …