Ошибка компиляции с использованием Rcpp с typedef

Я пишу некоторые компоненты C ++ для моего пакета R, используя RcppEigen, и у меня возникают проблемы с использованием typedef в этом контексте. Следующий код не скомпилируется:

// [[Rcpp::depends(RcppEigen)]]
#include <RcppEigen.h>

using namespace Rcpp;

typedef Eigen::ArrayXd MapAr1;

// [[Rcpp::export]]
MapAr1 myFun(const MapAr1& x){

MapAr1 y = x;
y[0] = 0;

return y;

}

Вот ошибка:

==> Rcpp::compileAttributes()

* Updated src/RcppExports.cpp
* Updated R/RcppExports.R

==> devtools::document(roclets=c('rd', 'collate', 'namespace'))

Updating my_package documentation
Loading my_package
Re-compiling my_package
'/usr/lib64/R/bin/R' --no-site-file --no-environ --no-save --no-restore  \
--quiet CMD INSTALL '/my_path/my_package'  \
--library='/tmp/RtmpgPjAdf/devtools_install_125071da0b53' --no-R --no-data  \
--no-help --no-demo --no-inst --no-docs --no-exec --no-multiarch  \
--no-test-load

* installing *source* package ‘my_package’ ...
g++ -m64 -I/usr/include/R -DNDEBUG  -I/usr/local/include -I"/my_path/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/Rcpp/include" -I" /my_path/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.3/RcppEigen/include"   -fpic  -O2 -g -pipe -Wall -Wp,-D_FORTIFY_SOURCE=2 -fexceptions -fstack-protector-strong --param=ssp-buffer-size=4 -grecord-gcc-switches   -m64 -mtune=generic  -c RcppExports.cpp -o RcppExports.o
** libs
RcppExports.cpp:10:1: error: ‘MapAr1’ does not name a type
MapAr1 myFun(const MapAr1& x);
^
RcppExports.cpp: In function ‘SEXPREC* my_package_myFun(SEXP)’:
RcppExports.cpp:15:42: error: ISO C++ forbids declaration of ‘type name’ with no type [-fpermissive]
Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP);
^
RcppExports.cpp:15:50: error: template argument 1 is invalid
Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP);
^
RcppExports.cpp:15:58: error: expected initializer before ‘x’
Rcpp::traits::input_parameter< const MapAr1& >::type x(xSEXP);
^
RcppExports.cpp:16:40: error: ‘x’ was not declared in this scope
rcpp_result_gen = Rcpp::wrap(myFun(x));
^
RcppExports.cpp:16:41: error: ‘myFun’ was not declared in this scope
rcpp_result_gen = Rcpp::wrap(myFun(x));
^
make: *** [RcppExports.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘my_package’
* removing ‘/tmp/RtmpgPjAdf/devtools_install_125071da0b53/my_package’
Error: Command failed (1)
Execution halted

Exited with status 1.

Тот же код компилируется вне пакета. Поэтому я предполагаю, что что-то не копируется должным образом в файлы RcppExports. Я также заметил похожую проблему при попытке использовать пространство имен RcppEigen: using namespace RcppEigen; не копируется

Есть идеи, как решить эту проблему, не изменяя вручную RcppExports?
Спасибо!

0

Решение

Вы делаете свою жизнь слишком сложной, настаивая на typedef, Как только вы включите его в файл, и ваша функция подпись, это становится частью интерфейса и, следовательно, также должно быть в вашем RcppExports.cpp, Таким образом, вы должны предоставить это «на один уровень выше».

Но для этого есть условие: вызвать файл pkgname_types.h и это будет включено. Я создал простой пакет eigentest и добавил файл eigentest_types.h в src/ каталог:

#include <RcppEigen.h>

typedef Eigen::ArrayXd MapAr1;

а затем добавил его в свой фрагмент кода с

#include "eigentest_types.h"

вместо typedef,

Это все, что вам нужно — просто замените eigentest с вашим именем пакета.

7

Другие решения

Других решений пока нет …

По вопросам рекламы [email protected]