Я пытаюсь отправить пакетные задания в SLURM, но продолжаю получать JobState=FAILED Reason=NonZeroExitCode
, Я могу нормально скомпилировать и запустить код на обычном g ++, но мне нужно использовать SLURM для школьного задания. Я думал, что запускаю их правильно, и получил от корня гадость на грани отказа от выполнения скриптов на узле входа в систему. Любая помощь будет оценена. Вот мой командный файл и мой Makefile:
#!/bin/bash
#SBATCH -N1 -n1 --mem-per-cpu=100m -t00:05:00
echo "#SBATCH -N1 -n1 --mem-per-cpu=100m -t00:05:00 --qos=test"cd /home/<username>/AFS/cse_430/Project1/Parallel/
module load gcc/4.9.1
make clean
make all
echo "Running single threaded code..."./run "SeqCA(57;4,10).txt"echo "Done experiment. Check log.txt"
Makefile:
EXEC=run # name of executable is run
CC=g++ # compile with g++
CFLAGS=-std=c++11 -fopenmp -c -Wall
all: $(EXEC)
$(EXEC): main.o threeSeq.o fourSeq.o fiveSeq.o
$(CC) -fopenmp -o $(EXEC) main.o threeSeq.o fourSeq.o fiveSeq.o
main.o: main.cpp
$(CC) $(CFLAGS) main.cpp
threeSeq.o: threeSeq.cpp threeSeq.hpp
$(CC) $(CFLAGS) threeSeq.cpp
fourSeq.o: fourSeq.cpp fourSeq.hpp
$(CC) $(CFLAGS) fourSeq.cpp
fiveSeq.o: fiveSeq.cpp fiveSeq.hpp
$(CC) $(CFLAGS) fiveSeq.cpp
clean:
rm -f *.o
rm -f $(EXEC)
rm -f *log.txt
Вы должны представить свою работу с:
sbatch jobscript.sh
Проверьте также выходные файлы из slurm, чтобы проверить наличие ошибок при выполнении задания. По умолчанию slurm сохраняет stdout и err в файле slurm-.out