fopen не открывает файл полностью

Я пишу программу, которая создает таблицу поиска из двух таблиц, которые находятся в двух отдельных файлах. Когда я читаю первую таблицу, все читается правильно. Тем не менее, когда я читаю второй файл, fopen кажется, не открыть весь файл.

Я говорю это потому, что компилятор реализует _iobuf структура файла и _cnt похоже инициализируется намного ниже (_cnt = 530) чем при инициализации в первый раз (_cnt ~ 4096) и, как я читал из файла, он уменьшается.

Вот фрагмент моего кода:

int vertical,horizontal,channels,count;
FILE *fp;

fp = fopen(filename,"r");
if(fp==NULL){
cout << "File not found" << endl;
return Mat();
}else{
cout << "Opening and Reading " << filename << endl;
}

//Read header
fread(&count,4,1,fp);
cout << "ReadHistogram(): Count number is " << count;
if(count!= 5){
cout << "Header file reads: " << count << endl;
return Mat();
}

//Read size
fread(&vertical,4,1,fp);
//cout << "ReadHistogram(): Vertical size:" << vertical <<endl;

fread(&horizontal,4,1,fp);
//cout << "ReadHistogram(): Horizontal size:" << horizontal <<endl;

fread(&channels,4,1,fp);
//cout << "ReadHistogram(): Channel size:" << channels<<endl;

//Create Mat array
int size[] = {vertical, horizontal, channels};
Mat histogram(3,size,CV_64F,Scalar::all(0));

//Read in array
count = 0;
for(int i=0;i<vertical;i++){
for(int j=0;j<horizontal;j++){
for(int k=0;k<channels;k++){
double temp5;
fread(&temp5,8,1,fp);
histogram.at<double>(i,j,k) = temp5;
if(count <= 300){
cout << "Array(" << i+1 << "," << j+1 << "," << k+1 << ")" << "=" << histogram.at<double>(i,j,k) << endl;
cout << "Temp5 is " << temp5 << endl;
}
count++;
}
}
}
cout << "Done reading " << filename << endl;
fclose(fp);
return histogram;

PS: я пытался посмотреть, что именно _cnt в FILE структура, и я не могу найти ничего подобного. Я был бы признателен за любые указания, которые может дать каждый.